Les organigrammes bactériens fournissent une aide visuelle pour l'identification rapide des espèces bactériennes. Pour créer un diagramme, identifiez d’abord les caractéristiques communes des différents groupes de bactéries afin d’exclure les groupes non pertinents et de déterminer plus efficacement les bactéries présentes. Divers logiciels possèdent les éléments géométriques nécessaires pour traiter un groupe à la fois, par coloration de Gram et par leur forme. Une espèce commune de bactéries cutanées, Staphylococcus aureus, offre un excellent point de départ. Chaque étape de l’organigramme est définie dans une forme géométrique telle qu’un rectangle, un ovale, un carré ou une boîte avec des lignes reliant chacune des étapes suivantes pour des organigrammes alignés. et horizontalement pour les cartes orientées paysage.
Spécifiez que la culture à tester est une culture pure. Identifiez également l’origine de l’échantillon pour réduire la plage de l’organigramme.
Écrivez ou tapez "Gram Stain" comme test principal et créez deux ramifications à partir de cette zone. Marquez les ramifications "Gram positif" et "Gram négatif". Les colorations à Gram positif, telles que Staphylococcus, apparaissent en violet et les colorations à Gram négatif, telles que E. coli, en rouge. Les bactéries sont réparties dans ces deux groupes et la coloration de Gram est le premier test effectué sur un échantillon inconnu, car il s’agit d’une procédure simple et peu coûteuse qui permet d’éliminer un grand pourcentage de possibilités.
Entrez les options suivantes dans une case ou une autre forme de l’organigramme, qui identifie la forme de la bactérie obtenue par analyse microscopique de la coloration de Gram. Les types de formes sont les tiges, les cocci, les sphères ou les ovoïdes, les spirilles, les tiges torsadées en spirale, les spirochètes, de très longues tiges torsadées en spirale, avec des bourgeons et des appendices et des parties filamenteuses. Les tiges et les cocci sont les plus communs. Staphylococcus s'identifie comme un coccus.
Divisez les étapes suivantes, cases ou autres formes de choix, en tests biochimiques pour chaque branche de l’organigramme. Celles-ci diffèrent par les différentes formes des groupes de Gram. Le test principal pour les coques à Gram positif est le test à la catalase utilisant du peroxyde d'hydrogène, et les options résultantes sont soit une catalase positive, soit une catalase négative. Par exemple, les espèces Micrococcus et Staphylococcus sont positives et les streptocoques sont négatives. Des exemples d’autres étapes pour des groupes en dehors des non-cocci et des non-Gram positifs incluent la fermentation du lactose ou la non-fermentation pour des bâtonnets à Gram négatif.
Analysez les propriétés de fermentation des bactéries dans l'élément suivant de l'organigramme. Les bactéries fermentent ou s'oxydent. Staphylococcus aureus est fermentatif par opposition à Micrococcus, qui est oxydant.
L'analyse de la fermentation est une étape commune pour l'identification des bactéries à Gram positif et négatif.
Ajoutez une autre ligne et une autre forme à l’organigramme. Cette étape représente un test de coagulation, un test biochimique appelé coagulase. Staphylococcus aureus produit l'enzyme coagulase et, lorsqu'il est testé avec un milieu approprié, il en résulte un caillot ressemblant à de la gelée. Tous les autres staphylocoques sont testés comme coagulase négative.
Des étapes alternatives pour d’autres groupes de bactéries incluent le test de l’oxydase pour les bâtonnets à Gram négatif, ou la fermentation rapide ou lente du lactose.