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Les champignons sont des cellules microscopiques qui se développent généralement sous forme de longs fils ou mèches appelées hyphes, qui se faufilent entre des particules de sol, des roches et des racines. Ils sont étroitement liés aux animaux et aux plantes et existent depuis environ un milliard d'années. Les humains partagent environ 80% de leurs gènes avec des champignons, ce qui signifie que votre voisin et votre champignon du jardin peuvent avoir plus de points communs en commun qu’il n’est à l’œil.
Au moins 70 000 espèces distinctes de champignons du sol ont été identifiées dans le monde entier. Ceux-ci peuvent être divisés taxonomiquement en quatre groupes: Zygomycota, Ascomycota, Basidiomycota, et Deutéromycota. Cependant, il est peut-être plus facile pour les observateurs ordinaires de penser à eux en termes de fonction et de propriétés métaboliques.
Champignons saprophytes
Les champignons saprophytes sont des décomposeurs. Les saprophytes fongiques décomposent la cellulose et la lignine présentes dans le sol en énergie. Les sous-produits métaboliques de ce processus comprennent le dioxyde de carbone, ou CO2et de petites molécules telles que les acides organiques; Certains de ces métabolites peuvent rester dans le sol environnant pendant des milliers d'années dans de bonnes conditions.
Les champignons saprophytes peuvent pousser dans une grande variété d'endroits en raison de la nature répandue des substances dont ils se nourrissent. Certains champignons saprophytes sont appelés "champignons du sucre" car ils utilisent les mêmes substrats que de nombreuses bactéries.
Champignons mutualistes
Les champignons mutualistes sont également appelés champignons mycorhiziens. Ces champignons du sol colonisent les racines des plantes et sont qualifiés de "mutualistes" car ils bénéficient de la présence des plantes et inversement. En contrepartie d'atomes de carbone de la plante, les champignons mycorhiziens aident les plantes à absorber facilement le phosphore et apportent également aux substances nutritives du sol, notamment l'azote, les micronutriments et l'eau, les plantes sur lesquelles elles sont ancrées.
Les champignons mutualistes comprennent deux groupes principaux. Les ectomycorhizes, qui poussent à la surface des racines des plantes, sont fréquemment observés sur les arbres ou à proximité. Le deuxième groupe principal, les endomycorhizes, se développent dans les cellules de la racine des plantes plutôt que sur celles-ci et sont généralement associées aux herbes, aux cultures en rangs, aux légumes et aux arbustes ordinaires.
Champignons pathogènes
Également appelés champignons parasites, ces champignons, contrairement aux mutualistes, entraînent une réduction de la production végétale, voire la mort de plantes lorsqu'elles colonisent des racines ou d'autres organismes du sol. Les champignons pathogènes pour les racines entraînent des pertes économiques annuelles importantes dans les entreprises agricoles. Cependant, bon nombre de ces champignons peuvent aider à lutter contre les maladies lorsqu'ils sont correctement déployés. Par exemple, les champignons piégeurs de nématodes parasitent les nématodes pathogènes, ou ascaris, tandis que les champignons qui tirent leur énergie d'insectes peuvent être utilisés comme agents de lutte antiparasitaire.
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