Contenu
- Définition du génotype
- Connaître le génotype: Punnett Square
- Réaction en chaîne de la polymérase
- Sonde d'hybridation
- Séquençage direct de l'ADN
Le terme génotype fait référence à la constitution génétique complète d'un organisme. Il est également utilisé pour décrire les différentes variations d'un gène, appelées allèles. Les humains ont deux allèles pour chaque position génétique, ou locus.Pris ensemble, chaque paire d'allèles est considérée comme un génotype spécifique.
Connaître le génotype ou un exemple de génotype d'un individu peut être important pour comprendre l'expression génétique, diagnostiquer des maladies, en apprendre davantage sur les mutations génétiques, etc.
Définition du génotype
Commençons par une définition spécifique du génotype. Un génotype d'individu est l'information génétique héréditaire de cet individu. Cela fait référence à vos gènes, à votre ADN, à vos allèles, etc., en un mot qui englobe tout. Un exemple consisterait à décrire un génotype de couleur de fleurs comme RR (signifiant qu'ils ont deux allèles "rouges", RR, pour leur couleur) ou Rr (un allèle "rouge", R et un allèle "rose", r, pour la couleur). .
Par contre, votre phénotype est ce que chaque individu montre physiquement, déterminé par son génotype. Bien que deux individus puissent avoir le même phénotype, ils pourraient avoir des génotypes complètement différents. En suivant l'exemple de fleur de plus tôt, les fleurs RR et Rr sembleraient être rouges car le rouge est dominant sur le rose. Cependant, leur génotype est différent, l'un étant homozygote (RR) et l'autre hétérozygote (Rr).
En savoir plus sur la définition, les allèles et des exemples de génotypes.
Connaître le génotype: Punnett Square
Un carré de Punnett est l’un des moyens les plus simples de déterminer un génotype. Le carré est en fait un mini-graphique utilisé pour déterminer le génotype potentiel d'une progéniture par rapport à un trait particulier.
Pour créer un carré de Punnett, écrivez tous les allèles possibles en haut du carré pour un parent et tous les allèles possibles pour l'autre parent en bas à gauche. Chaque allèle répertorié deviendra soit une colonne, pour les allèles supérieurs, soit une ligne, pour les allèles du côté gauche, à l'intérieur du carré. Le carré est rempli au fur et à mesure que vous écrivez les allèles du haut dans leurs colonnes respectives, puis les allèles du côté dans leurs lignes respectives, créant ainsi un carré plein de génotypes potentiels.
Un exemple de génotype utilisant le carré de Punnett est constitué par les expériences classiques sur pois réalisées par Gregor Mendel. Découvrez des exemples de génotypes spécifiques et des carrés de Punnett ici.
Réaction en chaîne de la polymérase
Développée dans les années 1980, la réaction en chaîne de la polymérase (PCR) génère un support spécifique d’ADN basé sur un brin matrice. En plus d'un brin matrice, l'ADN polymérase, les nucléotides et des bits courts d'ADN monocaténaire sont nécessaires pour une réaction PCR.
À un moment donné, la réaction de PCR commence à générer des copies de manière exponentielle, et seule la phase initiale permet de déterminer la quantité d'origine de la séquence cible dans l'échantillon. La méthode est utilisée à des fins de séquençage, de clonage et de génie génétique.
En savoir plus sur les différences entre le clonage PCR.
Sonde d'hybridation
Une sonde d'hybridation est utilisée pour déterminer si une caractéristique physique est due au génotype. Le processus commence par la digestion complète de l'ADN à analyser, suivie de son transfert sur une membrane filtrante. Ensuite, la sonde est ajoutée au filtre et autorisée à se lier à une séquence cible.
Après environ 24 heures, le filtre est lavé pour éliminer toute sonde non liée. Un prob hybride peut également être utilisé pour déterminer l'efficacité d'un processus de clonage ou pour déterminer le nombre de copies d'un gène spécifique.
Séquençage direct de l'ADN
Le projet du génome humain a conduit au développement d’un certain nombre d’outils puissants de séquençage d’ADN. En plus de décoder le génome complet de Homo sapiens, ces outils ont permis aux scientifiques de séquencer le génome complet de nombreux autres organismes, y compris les souris, les rats et le riz. Des outils de séquençage à la pointe de la technologie permettent aux généticiens d'aujourd'hui de comparer et de manipuler de grandes quantités d'ADN rapidement et à moindre coût.
Cela permettra de déterminer le rôle de la génétique dans la susceptibilité aux maladies, la réponse génétique des organismes aux stimuli de l'environnement et de suivre l'évolution d'un trait ou d'une espèce, selon l'Institut national de recherche sur le génome humain.