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Les microorganismes trouvés dans les eaux usées proviennent de deux sources: les sols et les déchets sanitaires. Un millilitre d'eaux usées généralementcontient entre 100 000 et 1 million de micro-organismes, selon le site Web du Mountain Empire Community College. Bien que la plupart de ces organismes, tels que divers types de bactéries,jouent un rôle central dans la décomposition des déchets et sont considérés comme faisant partie intégrante de la matière organique, dont certains sont pathogènes ou porteurs de maladies et constituent une menace pour la santé publique.
Bactéries Parasitaires
Les bactéries sont des organismes unicellulaires qui prolifèrent dans les matières en suspension, telles que les boues. Quand ils rencontrent un apport de nutriments, ils se nourrissent en prenantdans les aliments directement à travers la paroi cellulaire et se reproduisent rapidement. Parmi les nombreux types de bactéries présentes dans les eaux usées, les plus courants sont les coliformes fécaux, qui proviennent deles intestins humains et les voyages par les rejets humains. Ces bactéries parasites nécessitent un organisme vivant, ou un hôte, et un approvisionnement alimentaire facilement disponible.
Bactérie pathogène
Des formes spécifiques de bactéries parasites fabriquent des toxines qui causent des maladies dans l'organisme hôte. Ces types de bactéries pathogènes peuvent être libérés par les personnes souffrant de dysenterie,choléra, fièvre typhoïde et autres maladies de l'intestin. Les agents pathogènes généralement présents dans les eaux usées incluent Salmonella, Shigella, E. coli, Streptococcus, Pseudomonas aeroginosa,mycobacterium et Giardia Lamblia, selon le site Web du Conseil sur la qualité de l'eau et la santé. Les épidémies de shigellose sont dues à des coquillages d’eau douce contaminés par des eaux usées,comme le rapportent les centres américains de contrôle et de prévention des maladies. En raison de la croissance démographique et du rejet accru dans les eaux usées, l'abondance de bactéries pathogènes qui en résultesubmerge les processus naturels de décomposition et de dilution.
Bactéries Saprophytes
Les bactéries saprophytes dévorent les substances organiques mortes, ce qui aide à décomposer les déchets ensous-produits inorganiques et organiques. Ces bactéries jouent un rôle essentiel dans le traitement des eaux usées en facilitant ou en accélérant le processus de décomposition de la matière organique. Sans pour autantla décomposition des bactéries saprophytes peut ne pas se produire. Les différentes espèces de bactéries saprophytes périssent après avoir joué leur rôle dans le stade de décomposition concerné.
Les virus
Parmi les microbes trouvés dans les eaux usées, il y a des virus, qui sont des organismes parasites qui ont besoin de matière vivante pour se nourrir, se développer et se reproduire. Virus pathogènes existant dansles eaux usées comprennent la poliomyélite et l'hépatite. Divers virus intestinaux, tels que Coxsackie, Adenovirus et ECHO, ou un orphelin cytopathogène humain, sont également présents dans les effluents d’eaux usées.Un autre type de virus commun dans les eaux usées, qui s'attaque aux bactéries mais pas à l'homme, est appelé phage ou bactériophage. Contrairement aux bactéries, le nombre de pathogènesvirus dans les eaux usées est petit. Selon le site internet du Mountain Empire Community College, un seul virus infectieux pourrait exister parmi un million de bactéries coliformes.