Contenu
- La préparation des échantillons
- Construction automatique de séquenceurs d'ADN
- Injection automatique
- Détecteur
Les scientifiques ont la capacité de séquencer la molécule d'ADN; en d'autres termes, ils peuvent déterminer l'ordre des bases nucléotidiques dans une molécule donnée. Le séquençage de la molécule d’ADN peut être la première des nombreuses étapes nécessaires pour comprendre comment les nucléotides spécifiques d’une molécule d’ADN interagissent les uns avec les autres et codent des caractéristiques différentes dans un organisme. Le processus de séquençage de l'ADN est plutôt impliqué, mais les séquenceurs automatiques d'ADN minimisent la participation humaine nécessaire, pour au moins une partie du processus.
La préparation des échantillons
Pour qu'un séquenceur automatique d'ADN fonctionne, il doit détecter les quatre bases nucléotidiques constituant l'ADN: l'adénine, la guanine, la thymine et la cytosine. Les scientifiques copient plusieurs fois un fragment d'ADN et utilisent des enzymes de restriction pour le couper en fragments de tailles variables. Ils ajoutent ensuite une petite quantité de base marquée fluorescente à chaque lot d’ADN. La base, qui est soit l'adénine, la thymine, la guanine ou la cytosine, se liera à son complément de base à l'extrémité d'un brin. Par exemple, l'adénine se lie aux brins se terminant par la thymine et la guanine se lie aux brins se terminant par la cytosine.
Construction automatique de séquenceurs d'ADN
Un séquenceur automatique d’ADN est construit un peu comme un séquenceur d’ADN nécessitant plus de travail manuel. Plus précisément, un séquenceur automatique d’ADN est un réservoir d’environ 1 pied de long avec 96 puits de gel dans lequel l’ADN peut être versé. Dans un séquenceur d’ADN automatique, comme dans tout séquenceur d’ADN, l’ADN est injecté dans les puits de gel situés en haut du réservoir et une charge négative est appliquée à cette extrémité du réservoir. La charge négative incite fortement les brins d’ADN à parcourir différentes distances, jusqu’à la fin du réservoir.
Injection automatique
Un séquenceur automatique d’ADN injecte automatiquement des lots d’ADN dans la partie supérieure du gel. En tant que tel, il fait économiser énormément de temps et d’efforts aux chercheurs. Une fois les lots injectés, le séquenceur applique automatiquement une charge négative à une extrémité du réservoir, ce qui provoque la migration des brins à différentes distances à travers le gel. Les différentes distances reflètent les différentes tailles de brins d’ADN traversant le gel.
Détecteur
De nombreuses machines automatiques de séquençage d'ADN sont installées pour détecter le colorant fluorescent sur les brins d'ADN traversant le gel. Ce faisant, ils peuvent identifier les nucléotides situés aux extrémités des brins et les enregistrer dans l'ordinateur. Cependant, au mieux, les séquenceurs présentent une version confondue des nucléotides de l'ADN. Après avoir utilisé un séquenceur automatique d'ADN, vous devez suivre un processus appelé "finition", dans lequel une combinaison d'ordinateurs et de chercheurs trie les résultats de la détection de brin d'ADN afin d'assembler les données dans une description complète d'un brin d'ADN. Sans surprise, ce processus peut prendre beaucoup plus de temps que le processus de séquençage.