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La courbe de progression de la maladie sous la maladie (AUDPC) est une mesure quantitative de l'intensité de la maladie en fonction du temps. Il est utilisé en phytopathologie pour indiquer et comparer les niveaux de résistance aux maladies parmi les variétés de plantes. La méthode trapézoïdale est le moyen le plus courant de calculer AUDPC. Elle est réalisée à l'aide d'une formule conçue par Campbell et Madden en 1990 ou en traçant un graphique du pourcentage d'infection par rapport au temps et en faisant la somme des trapèzes entre les intervalles de temps.
Mesurer la progression de la maladie
Les règles et directives de recherche qui s'appliquent à la mesure de la maladie et de la culture spécifiques sur lesquelles vous étudiez. La taille requise de l'échantillon de plante varie selon la culture et la maladie. L'étude du mildiou dans les tubercules, par exemple, nécessite un échantillon minimum de 40 plantes.
Plantez le nombre approprié de plantes nécessaires à l’étude.
Surveillez attentivement les signes de la maladie. Faites des recherches lorsque des signes sont attendus pour vous préparer. Par exemple, les signes de mildiou se manifestent environ 30 à 40 jours après la plantation et 10 jours après la dernière application de fongicide.
Estimez visuellement le pourcentage de surface foliaire infectée dans votre échantillon dès que vous remarquez la maladie.
Notez le pourcentage de surface foliaire infectée à intervalles réguliers. Les chercheurs lisent tous les sept jours le mildiou si la maladie progresse plus rapidement que prévu. Les lectures sont prises tous les 14 jours lorsque la progression de la maladie est plus lente.
Arrêtez d'enregistrer les mesures d'infection lorsque le pourcentage d'infection cesse d'augmenter et les niveaux de progression de la maladie.
Calculer AUDPC à partir d'une équation
Ajoutez les deux premiers pourcentages d’infection que vous avez enregistrés.
Divisez le résultat de l'addition par deux pour trouver la valeur moyenne ou moyenne des deux lectures.
Multipliez la valeur moyenne ou moyenne par l'intervalle de temps, qui correspond au nombre de jours entre la première lecture et la deuxième lecture. Si vous avez pris la première lecture le jour 20 et la deuxième lecture le jour 27, par exemple, le nombre de jours, ou intervalle de temps, est de sept jours.
Enregistrez le résultat en unités de pourcentage de jours. La valeur est une zone d'un trapèze.
Répétez les étapes 1 à 4 pour les deuxième et troisième lectures d'infection que vous avez prises. Leur résultat sera la zone d'un deuxième trapézoïde. Répétez les étapes 1 à 4 jusqu'à ce que vous ayez calculé les surfaces trapézoïdales pour toutes les lectures.
Ajoutez tous les trapèzes pour trouver le AUDPC. Les AUDPC inférieurs représentent une progression plus lente de la maladie et une plus grande résistance à la maladie. Des AUDPC plus élevés représentent une progression plus rapide de la maladie et une plus grande susceptibilité à la maladie.