Comment calculerFréquences de recombinaison

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Auteur: Robert Simon
Date De Création: 20 Juin 2021
Date De Mise À Jour: 14 Peut 2024
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Comment calculerFréquences de recombinaison - Science
Comment calculerFréquences de recombinaison - Science

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Si vous étudiez la génétique, vous avez probablement appris que les gènes sont souvent déclinés en plusieurs versions distinctes (généralement deux)."allèles" et l'un de ces allèles est généralement "dominant" sur l'autre, ce dernier étant appelé copie "récessive". Vous savez que tout le monde porte autour de deuxallèles pour chaque gène et obtient un allèle de chaque parent.


Pris ensemble, ces faits impliquent que si vous avez des parents avec un génotype connu pour le gène en question - c'est-à-direvous savez quels allèles ils sont capables de contribuer - vous pouvez utiliser les mathématiques de base pour prédire la probabilité qu'un enfant de ces parents ait un génotype donné, et par extension,les chances qu'un enfant affiche un phénotype donné, qui est l'expression physique de traits génétiquement codés.

En réalité, la microbiologie de la reproduction est un échecces chiffres en raison d'un phénomène appelé "recombinaison".

Héritage mendélien simple

Supposons que chez une espèce d’extra-terrestres mignons, les cheveux mauves dominent les cheveux jauneset que ces allèles sont représentés par les lettres P et p. De même, supposons que les têtes rondes (R) dominent les têtes plates (r). Sur la base de ces informations, si vous savez que chaquele parent est hétérozygote pour ces deux traits - c'est-à-dire que la mère et le père ont un allèle dominant et un allèle récessif à la fois sur l'emplacement du gène de la couleur des cheveux(locus) et le locus du gène en forme de tête - vous savez alors que chaque parent a le génotype PpRr et que les génotypes possibles de la progéniture sont PPRR, PPRr, PPrr, PpRR,PpRr, Pprr, ppRR, ppRr et pprr.


Un carré de Punnett (non illustré; voir la section Ressources pour un exemple de croix de dihydridre de ce type) révèle que le ratio de ces génotypes est1: 2: 1: 2: 4: 2: 1: 2: 1, ce qui produit un rapport phénotypique de 9: 3: 3: 1. C’est-à-dire que, pour un total de 16 enfants produits par ces parents, on s’attend à 9 enfants aux cheveux mauves,bébés à tête ronde; 3 bébés aux cheveux violets et à tête plate; 3 bébés aux cheveux jaunes et à tête ronde; et 1 bébé aux cheveux plats et aux cheveux jaunes. Ces ratios s’établissent à 9/16 = 0,563,3/16 = 0,188, 3/16 = 0,188 et 1/16 = 0,062. Celles-ci peuvent également être exprimées en pourcentages en les multipliant par 100.

Cependant, la nature introduit une ride critique dans cesnombres: de tels calculs supposent que ces allèles sont hérités indépendamment, mais le phénomène de "liaison génique" dément cette hypothèse.


Liens génétiques: définition

Les gènes proches qui codent pour différents traits peuvent être transmis comme une unité grâce à un processus appelé "recombinaison" qui se produit pendant la reproduction sexuée dans le cadre d'uneéchange de matériel génétique appelé "croisement". La probabilité que cela se produise dans une paire de gènes est liée à la proximité physique des gènes sur le chromosome.

Pensez à une petite tempête de pluie dans votre ville lorsque tout le monde se trouve à l'extérieur et fait des choses différentes. Si vous êtes pris sous la pluie, quelles sont les chances qu’une personne choisie au hasardami sera également parmi ceux trempés? Clairement, cela dépend de la proximité de l'ami sélectionné. La liaison génique fonctionne selon le même principe de base.

Fréquence de recombinaison

Pour déterminer à quel point deux gènes s'approchent l'un de l'autre à l'aide de données relatives à la reproduction - c'est-à-dire pour résoudre des problèmes de cartographie génétique - les scientifiques se tournent versà la différence entre les rapports phénotypiques prévus dans une population de progéniture et les rapports réels. Ceci est fait en croisant un parent "dihybride" avec une progéniturecela montre les deux traits récessifs. Dans le cas de notre biologie de liaison extraterrestre, cela signifie traverser un extraterrestre aux cheveux roux et à tête arrondie (qui, dans le cas d’un organisme dihybride,génotype PpRr) avec le produit le moins probable d’un tel accouplement - un extraterrestre aux cheveux jaunes et à tête plate (pprr).

Supposons que cela donne les données suivantes pour 1 000 enfants:

La solution pour résoudre les problèmes de mappage des liens consiste à reconnaître que la progéniture qui est phénotypiquement identique à l’un ou l’autre des parents est la progéniture recombinante - dans ce cas,une progéniture aux cheveux violets, à tête ronde et une progéniture aux cheveux jaunes et à tête plate. Cela permet de calculer la fréquence de recombinaison, qui est simplement recombinante.descendance divisée par la progéniture totale:

(102 + 98) ÷ (102 + 396 + 404 + 98) = 0.20

Les généticiens calculent le pourcentage correspondant pour attribuer le degré de liaison génétique, qui a des unités de "centimorgans" ou cM.Dans ce cas, la valeur est 0,20 fois 100 ou 20%. Plus le nombre est élevé, plus les gènes sont liés physiquement.